【使徒】 超科学的な能力を持つ、人類の敵とされている謎の存在。直径十キロにも及ぶ巨大なものから、マイクロマシンクラスの微小なものまで、そのサイズは様々。フォルムも人型のものや正八面体、実体を持たない「影」まで、それぞれが異なった外見と能力を有している。それらの目的は様々で、あるものは何も考えず、あるものはアダムを目指すなど特殊な場合もあるが、大体のものが一様に第三新東京市の地下ジオフロントに眠る巨人を目指して侵攻してくる。使徒は粒子と波、両方の性質を備える光のようなもので構成されており、構成素材の違いはあるが、その固有波形パターンは人間の遺伝子と酷似していた。
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