庵野監督の他作品のようになったのではないでしょうか。
つまり、ナディアや、トップをねらえ、のように元気な女の子が主人公になったと思います。
そして、心理描写シーンはなくなったでしょう。

もともと庵野監督は主人公は女の子にする予定でした。しかし、貞本さんが強く主張して、主人公を男の子に変えさせたとインタビューで見た記憶があります。

主人公が男の子に変わったことで、初めて、庵野監督が作品のキャラとシンクロしはじめ、その結果、精神描写が深くなり、監督の様々なコンプレックスも前面に出るようになったと思います。

その意味で、主人公が女の子のままでしたら、単に明るい元気な女の子のお笑い交じりの活躍アクションとなり、現在のような伝説的なエヴァの成功はなかったでしょう。