惑星メルキア
ウド
彼の名は、ファミン・エルム
ファミンは見た
謎のＡＴたちが彼の両親を襲ったのを・・
そして 彼はすべてを失った
ファミンは父の倉庫のＡ・Ｔに乗り込んだ！
ファミン「なぜだ、なぜとうさん、母さんを！？」
・・戦い・・
武器：アームパンチのみ
ファミン「しまった！ オーバーヒートか！」
＊ここは、どのように戦っても必ずオーバーヒートになる。
タイトル
ファミン「ここはどこだ・・・・・？そうか ぼくは やつらとの戦いで・・」
ヨーグル「お目覚めかい、ぼうや・」
ヨーグル「私はヨーグル、けちな武器商人さ、バトリングのね・・」
ファミン「バトリング・・、そうだ 父さんの仇もボトムズ乗りだった・・」
ファミン「バトリングにでればきっと！！
ヨーグル「バトリングにでるのかい？ぼうやも好きだねぇ・・」
STAGE1 ＷＯＯＤＳ
Battｌing in WOODS
ファミン搭乗機はスコープドッグ（ＡＴＭ−０９−ＳＴ）
武器：アームパンチとヘビィマシンガン
＜スコープドッグ（ＡＴＭ−０９−ＳＴ）＞
戦闘
敵は３機
＊敵は弱く、数も少ない。
ファミン「このウドに父さんの仇はいなかった・・やつはどこだ・・」
ヨーグル「あたしゃボルフの町へのいくよ。でかい試合があってね。
ファミン「あのあらくれものの集まる街か、ひょっとして、そこに父さんの仇が・・」
ヨーグル「気をつけな。このウドからあんたをださないようにみはっている男達がいるようだよ・・」
STAGE2 ＥＸＯＤＵＳ
パスワード BYEWOODO
高速移動バトル（敵を倒すより、突破が目的）
＊最後は戦車。それを倒すと脱出成功として次ステージへ。
ＳＴＡＧＥ3 ＷＯＬＦ
パスワード FOR WOLF
極点の街ボルフ
ここはバトリングの街・・
ブリザードに閉じ込められた闘争の街・・
STAGE3-1
BATTLING in WOLF１
STAGE3-2
BATTLING IN WOLF-2
ファミン搭乗機はスコープドッグ（ＡＴＭ−０９−ＳＴ）
武器：アームパンチとマシンガンとミサイル
＊２試合連続で、バトリング（相手は３機〜５機ぐらいだったと思う）となる。
ヨーグル「なかなかやるじゃない・・でも あんたの人気をねたむやつがいるらしいよ・・気をつけて」
その夜、ファミンは襲撃をうけた！！
ガタ「ガキが、つげがあがるんじゃねえ！親父のようになりたいのか」
ファミン「！！ そのＡＴは父さんを襲った！！」
ガタ「そうよ。おれさまは、ガタ・パッカード。お前にチラチラされちゃ、目障りなのよ・・」
STAGE４ REVENGE
パスワード OPPONENT
ガタとの一騎打ち
ファミン搭乗機はスコープドッグ（ＡＴＭ−０９−ＳＴ）
武器：アームパンチとマシンガンとミサイル
ガタは、スタンディングトータス ガタ・スペシャル（ＡＴＨ−１４−ＳＴＣ）に搭乗
＜ガタ・スペシャル（ＡＴＨ−１４−ＳＴＣ）＞
戦闘
＊この敵は仇だが、そんなに特別強いわけではない。
ついに仇のガタを倒した。
ヨーグル「ファミン、ああファミン！！生きていたのね 良かった・・・」
ヨーグル「・・・・」
ガタ「ふふふふ・・・これですべてがおわったつもりか？俺様は金でやとわれただけだぜ」
ファミン「なに？本当の仇はべつにいるのか？」
ガタ「そいつに会いたきゃ、シャトルで そらへ上がれ。もっとも いきて帰れないかもしれねぇが。くくくっく。」
ヨーグル「行くの、ファミン！？・・・」
ファミン「・・・・」
ヨーグル「シャトルへの道はメルキア軍がおさえているわ！」
ヨーグル「もう これ以上のあぶないまねはやめて！！」
ファミン「でも、ぼくは聞いてしまった！！」
ファミンの前にメルキア軍があられた！！
STAGE5 SHUTTLE BASE
パスワード SHUTTLE
高速移動バトル
*最後は砲台。一番左に行くと、相手の左の砲台からの死角となる。
「！！！」
ファミンの前に一騎のATが立ちはだかった
ファミン「だれだおまえは！？」
ヨーグル「私よ ファミン」
ファミン「！！・・・ヨーグルか！？」
ヨーグル「わたしはメルキア軍の情報将校。あなたに近づいたのはバトリングを裏で支配する男を追うため。
でも もうやめて！！ これ以上は危険だわ！・・・」
ヨーグル「力づくでもあなたを行かせない！」
ＳＴＡＧＥ６
ＹＯＵＧＬＥ
パスワード SADNESS
（ヨーグルとの戦い）
ファミン搭乗機はスコープドッグ（ＡＴＭ−０９−ＳＴ）
武器：アームパンチとマシンガンとミサイル
＊ヨーグルはさきほどのガタより余程強い。
ファミン「すまない ヨーグル・・・」
ヨーグル「行きなさい ファミン。そこまでのかくごなら・・・」
ヨーグル「このＡ・Ｔはせめてものはなむけよ・・・」
（青いＡＴガスティドッグをもらう）
＜ガスティドッグ（ＡＴＨ−１１−ＳＡ）＞
（シャトルにのって宇宙へ）
ファミン「これからが 本当の戦いだ」
シャトルの前になぞの船があらわれた
アナヒサ「ようこそ ファミン。私はアナヒサ。最強の戦士を集め最強のＡ／Ｔを開発する男だ」
ファミン「なぜ父さんを！！」
アナヒサ「お前の父はＡＴの戦闘プログラムの開発者だった」
アナヒサ「しかし 私の目的を知り、プログラムをある場所へかくしたのだ。お前の潜在意識のの中へな」
ファミン「ぼくの 意識の中？」
アナヒサ「さあ、 お前の意識をいただこう。そして百年戦争復活の引き金とするのだ！！」
STAGE７ ENEMY SHIP
ファミン「アナヒサ！かくご！」
アナヒサ「来い！！おまえがてごわいほど、私の野望達成の証明となるのだ！！」
ファミン搭乗機はガスティドッグ（ＡＴＨ−１１−ＳＡ）
武器：アームパンチとヘビィマシンガンとミサイル
＊敵は多数（７〜８機ぐらい）。数が多いので、結構きつい。勝利すると次ステージのアナヒサとの対決へ。
ＳＴＡＧＥ８ ＬＡＳＴ ＢＡＴＴＬＥ
パスワード GOODLUCK
ファミン搭乗機はガスティドッグ（ＡＴＨ−１１−ＳＡ）
武器：アームパンチとヘビィマシンガンとミサイル
アナヒサはスカラップス ＳＬ（ＸＡＴＨ−０７−ＤＡ）に搭乗
＊このマシンは、一度破壊されると、変形し、より強力になる！（ボトムズ的というよりゲーム的なラスボスである。）
＜スカラップス ＳＬ（ＸＡＴＨ−０７−ＤＡ）＞
戦闘
＊敵はもの凄く早い！！しかも、倒したと思ったら、さらにパワーアップして変形復活する！！
基本的にパンチのみが確実だが、ギリギリ負けそうな時はミサイルを撃ちまくった。
ファミン「長い道のりだった・・仇はとったよ・・父さん」
アナヒサ「ワグググ・・・百年戦争は復活する！例え私がほろびようとも・・」
爆発
ファミン「！！」
（宇宙空間にＡ・Ｔごと放り出されたファミン）
ファミン「ぼくは生きている・・・これも父さんの意思か・・・」
ヨーグル「ファミン・・・ファミン・・！！」
ファミンの前にシャトルがあらわれた
ファミン「ヨーグル・・ヨーグルか！？」
ファミン！！
エンド